センター・メロディは、意識してコード構成音と合わせるようにします。
理由はかんたん。そうしないと、ヴォーカルが歌いづらいからです。
音感の良いヴォーカルならば、Cコード上で「レ」がセンター・メロディであっても、音をとることができます。
が、それでもあまり親切ではないでしょう。コード構成音に含まれる音をセンター・メロディにした方が明らかに歌いやすいです。
コード構成音に含まれない音がセンター・メロディの場合、正確に音をとれないとへたっぴに聴こえてしまします。
だから、なるべくセンター・メロディとコード構成音は合わせる。または、コード構成音の中からセンター・メロディを選んでメロディつくりをするのです。
それを基本として、あえてセンター・メロディとコード構成音を合わせない場合、その条件は
・音感の良いヴォーカルが歌う場合
・インスト曲の場合
です。インストならば、楽器で音を正確にとれますから、問題ないというわけ。その場合は、「センター・メロディがテンションノートであるとみなす」と考えればいいのです。
Cコード上で「レ」をセンター・メロディとして使っているならば、そこは「Cadd9」と考えればいいわけです。
上記以外の場合は、基本的にセンター・メロディとコード構成音は合わせるようにします。